Με την ολοκλήρωση της βαθμολόγησης για το μάθημα "Χρήση Η/Υ και Βάσεις Βιολογικών Δεδομένων" θα ήθελα να ευχαριστήσω όλους/ες όσους/ες έστειλαν ασκήσεις για την προσπάθεια τους και να σας συγχαρώ ως επιτυχόντες/ουσες.
Και οι τρεις ασκήσεις βαθμολογήθηκαν ισοβαρώς, ο τελικός βαθμός δηλαδή είναι η μέση τιμή των βαθμών στις τρεις ασκήσεις κάθεμία από τις οποίες βαθμολογήθηκε στην κλίμακα 0-10. Η βαθμολόγηση δεν έγινε με προαπαιτούμενο επιτυχία σε όλες τις ασκήσεις, κάποιος δηλαδή που έπαιρνε κάτω από τη βάση (5) σε μία ή και σε δύο από τις ασκήσεις, βαθμολογούταν κανονικά με το μέσο όρο και των τριών. Επίσης στις λίγες περιπτώσεις που δεν έλαβα κάποια από τις τρεις, ο βαθμός υπολογιζόταν ως η μέση τιμή των τριών ασκήσεων με βαθμό=0 για τις ασκήσεις που δεν παραδίδονταν.
Αναλυτικά τώρα για τις τρεις ασκήσεις τα ζητούμενα και η κλίμακα αξιολόγησης είχε ως εξής:
1. Πρώτη Άσκηση
α) Στην πρώτη άσκηση η βάση (5) δινόταν εφόσον η αναζήτηση είχε αποφέρει λογικά αποτελέσματα και αυτά παρουσιάζονταν σωστά σε πίνακα/πινακες.
β) Δύο επιπλέον μονάδες δίνονταν στην περίπτωση που η άσκηση συνοδευόταν από γραφική παράσταση (ιδανικά, δύο καμπύλες στην ίδια γραφική παράσταση).
γ) Μία επιπλέον μονάδα δινόταν για την περίπτωση που οι γραφικές συνοδεύονταν από καμπύλες προσομοίωσης (trendlines) μαζί με την αντίστοιχη εξίσωση για την κάθεμια. Επιπλέον βαθμός δόθηκε σε όσους προσομοίωσαν τις καμπύλες με καμπύλη παραβολής (δευτεροβάθμια) καθώς το σχήμα των γραφικών φαινόταν να υπακούει καλύτερα μια τέτοια σχέση. Ωστόσο γραμμικές προσομοιώσεις (εξισώσεις ευθείας) ή ανώτερα πολυώνυμα (και εκθετικές) θεωρήθηκαν επίσης σωστά.
δ) Από μία έως δύο μονάδες επιπλέον δόθηκαν για τη συνολική εικόνα της αναφοράς (δομή, θέση πινάκων, γραφικών, υποκεφαλίδες κλπ)τον σχολιασμό των αποτελεσμάτων. Περιληπτικά ο σχολιασμός περιλαμβάνει τα εξής βασικά συμπεράσματα:
- Έναρξη δημοσιεύσεων νωρίτερα για το Παν. Πατρών ως παλαιότερο Ίδρυμα
- Σταδιακή υποχώρησή του σε σχέση με το πιο δυναμικό Παν. Κρήτης (που υποστηρίζεται από τις κλίσεις των καμπυλών)
- Πτώση στους αριθμούς δημοσιεύσεων και των δύο Ιδρυμάτων στην τριετία 2009-2012 (πιθανόν λόγω κρίσης υποχρηματοδότησης)
- Έντονη αύξηση δημοσιεύσεων στα αμέσως επόμενα χρόνια και για τα δύο Ιδρύματα (πιθανότατα λόγω μαζικών δημοσιεύσεων συσσωρευμένων δεδομένων)
Συνολικά:
Πίνακες +5
Γραφικές +2
Προσομοιώσεις καμπυλών +1 ή +2
Σχολιασμός-Γενική Παρουσίαση +1 ή +2
Ο μέσος όρος σας στην Άσκηση 1 ήταν εξαιρετικά υψηλός: 8.81
2. Δεύτερη Άσκηση
α) Η βάση δίνεται σε όσους βρήκαν το σωστό αριθμό γονιδίων. Αυτός ανάλογα με την έκδοση που επιλέγει κανείς κυμαίνεται μεταξύ 6600-6700 γονίδια. Οι περισσότεροι βρήκαν σωστά τον αριθμό αυτό να είναι ίσος με 6692 γονίδια.
β) Τρεις επιπλέον μονάδες δίνονταν για τη σωστή δημιουργία του ιστογράμματος μηκών. Σας θυμίζω εδώ ότι το ιστόγραμμα έχει σκοπό να παρουσιάσει περιληπτικά την κατανομή ενός μεγέθους κι έτσι είναι απαραίτητο να δημιουργήσει κανείς ομάδες μηκών και να μετρήσει το πλήθος των γονιδίων σε κάθε ομάδα (π.χ. από 0-1000 βάσεις είχα 2500 γονίδια, από 1001-2000 βάσεις 1500 γονίδια κ.ο.κ.). Οι περισσότεροι εδώ δυστυχώς παρουσιάσατε απλώς ένα ραβδόγραμμα των μηκών που δίνει ελάχιστες πληροφορίες και ΔΕΝ είναι το ζητούμενο.
γ) Δύο επιπλέον μονάδες δίνονταν για την παρουσίαση της κατανομής γονιδίων ανά χρωμόσωμα είτε με τη μορφή ραβδογράμματος, ή με τη μορφή πίτας.
Έξτρα μέρος βαθμών δόθηκε στην περίπτωση που η ανάλυση συνοδευόταν από σχόλια για το πιθανό μέσο μήκος γονιδίων του Σακχαρομύκητα και τα χρωμοσώματα με το μεγαλύτερο/μικρότερο αριθμό γονιδίων.
Συνολικά:
Αριθμός γονιδίων +5
Σωστό Ιστόγραμμα +3
Κατανομή ανά χρωμόσωμα +2
Λόγω κυρίως των λάνθασμένων απαντήσεων στο ιστόγραμμα, ο μέσος όρος σας στην Άσκηση 2 ήταν: 7.28
3. Τρίτη Άσκηση
α) Η βάση δόθηκε σε όσους εντόπισαν έστω μία εξπανσίνη και δημιούργησαν μια παρουσίαση με τα βασικά χαρακτηριστικά της.
β) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους σχολίασαν την οικογένεια και όχι μόνο ένα μέλος.
γ) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους εντόπισαν αλληλεπιδράσεις και τις ανέφεραν (είτε σαν δίκτυο, είτε σαν λίστα).
δ) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους ανέφεραν τις λειτουργικές υπομονάδες των εξπανσινών από την Prosite.
ε) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους παρουσίασαν τις διάφορες πρωτεϊνες σε ξεχωριστά slides με τα επιμέρους χαρακτηριστικά της καθεμίας, αντί π.χ. για slides που είχαν όλες τις αλληλουχίες μαζί, μετά όλες τις δομές μαζί κλπ, τα οποία δεν είναι λειτουργικά.
στ) Μία μονάδα επιπλέον δόθηκε ανάλογα με την αισθητική της παρουσίασης (χρήση χρωμάτων, γραμματοσειρών κλπ)
Συνολικά:
Μια εξπανσίνη +5
Οικογένεια +1
Αλληλεπιδράσεις +1
Λειτουργικές υπομονάδες (domains) +1
Διακριτή παρουσίαση +1
Αισθητική παρουσίασης +1
Ο μέσος όρος σας στην Άσκηση 3 ήταν: 7.98
Και οι τρεις ασκήσεις βαθμολογήθηκαν ισοβαρώς, ο τελικός βαθμός δηλαδή είναι η μέση τιμή των βαθμών στις τρεις ασκήσεις κάθεμία από τις οποίες βαθμολογήθηκε στην κλίμακα 0-10. Η βαθμολόγηση δεν έγινε με προαπαιτούμενο επιτυχία σε όλες τις ασκήσεις, κάποιος δηλαδή που έπαιρνε κάτω από τη βάση (5) σε μία ή και σε δύο από τις ασκήσεις, βαθμολογούταν κανονικά με το μέσο όρο και των τριών. Επίσης στις λίγες περιπτώσεις που δεν έλαβα κάποια από τις τρεις, ο βαθμός υπολογιζόταν ως η μέση τιμή των τριών ασκήσεων με βαθμό=0 για τις ασκήσεις που δεν παραδίδονταν.
Αναλυτικά τώρα για τις τρεις ασκήσεις τα ζητούμενα και η κλίμακα αξιολόγησης είχε ως εξής:
1. Πρώτη Άσκηση
α) Στην πρώτη άσκηση η βάση (5) δινόταν εφόσον η αναζήτηση είχε αποφέρει λογικά αποτελέσματα και αυτά παρουσιάζονταν σωστά σε πίνακα/πινακες.
β) Δύο επιπλέον μονάδες δίνονταν στην περίπτωση που η άσκηση συνοδευόταν από γραφική παράσταση (ιδανικά, δύο καμπύλες στην ίδια γραφική παράσταση).
γ) Μία επιπλέον μονάδα δινόταν για την περίπτωση που οι γραφικές συνοδεύονταν από καμπύλες προσομοίωσης (trendlines) μαζί με την αντίστοιχη εξίσωση για την κάθεμια. Επιπλέον βαθμός δόθηκε σε όσους προσομοίωσαν τις καμπύλες με καμπύλη παραβολής (δευτεροβάθμια) καθώς το σχήμα των γραφικών φαινόταν να υπακούει καλύτερα μια τέτοια σχέση. Ωστόσο γραμμικές προσομοιώσεις (εξισώσεις ευθείας) ή ανώτερα πολυώνυμα (και εκθετικές) θεωρήθηκαν επίσης σωστά.
δ) Από μία έως δύο μονάδες επιπλέον δόθηκαν για τη συνολική εικόνα της αναφοράς (δομή, θέση πινάκων, γραφικών, υποκεφαλίδες κλπ)τον σχολιασμό των αποτελεσμάτων. Περιληπτικά ο σχολιασμός περιλαμβάνει τα εξής βασικά συμπεράσματα:
- Έναρξη δημοσιεύσεων νωρίτερα για το Παν. Πατρών ως παλαιότερο Ίδρυμα
- Σταδιακή υποχώρησή του σε σχέση με το πιο δυναμικό Παν. Κρήτης (που υποστηρίζεται από τις κλίσεις των καμπυλών)
- Πτώση στους αριθμούς δημοσιεύσεων και των δύο Ιδρυμάτων στην τριετία 2009-2012 (πιθανόν λόγω κρίσης υποχρηματοδότησης)
- Έντονη αύξηση δημοσιεύσεων στα αμέσως επόμενα χρόνια και για τα δύο Ιδρύματα (πιθανότατα λόγω μαζικών δημοσιεύσεων συσσωρευμένων δεδομένων)
Συνολικά:
Πίνακες +5
Γραφικές +2
Προσομοιώσεις καμπυλών +1 ή +2
Σχολιασμός-Γενική Παρουσίαση +1 ή +2
Ο μέσος όρος σας στην Άσκηση 1 ήταν εξαιρετικά υψηλός: 8.81
2. Δεύτερη Άσκηση
α) Η βάση δίνεται σε όσους βρήκαν το σωστό αριθμό γονιδίων. Αυτός ανάλογα με την έκδοση που επιλέγει κανείς κυμαίνεται μεταξύ 6600-6700 γονίδια. Οι περισσότεροι βρήκαν σωστά τον αριθμό αυτό να είναι ίσος με 6692 γονίδια.
β) Τρεις επιπλέον μονάδες δίνονταν για τη σωστή δημιουργία του ιστογράμματος μηκών. Σας θυμίζω εδώ ότι το ιστόγραμμα έχει σκοπό να παρουσιάσει περιληπτικά την κατανομή ενός μεγέθους κι έτσι είναι απαραίτητο να δημιουργήσει κανείς ομάδες μηκών και να μετρήσει το πλήθος των γονιδίων σε κάθε ομάδα (π.χ. από 0-1000 βάσεις είχα 2500 γονίδια, από 1001-2000 βάσεις 1500 γονίδια κ.ο.κ.). Οι περισσότεροι εδώ δυστυχώς παρουσιάσατε απλώς ένα ραβδόγραμμα των μηκών που δίνει ελάχιστες πληροφορίες και ΔΕΝ είναι το ζητούμενο.
γ) Δύο επιπλέον μονάδες δίνονταν για την παρουσίαση της κατανομής γονιδίων ανά χρωμόσωμα είτε με τη μορφή ραβδογράμματος, ή με τη μορφή πίτας.
Έξτρα μέρος βαθμών δόθηκε στην περίπτωση που η ανάλυση συνοδευόταν από σχόλια για το πιθανό μέσο μήκος γονιδίων του Σακχαρομύκητα και τα χρωμοσώματα με το μεγαλύτερο/μικρότερο αριθμό γονιδίων.
Συνολικά:
Αριθμός γονιδίων +5
Σωστό Ιστόγραμμα +3
Κατανομή ανά χρωμόσωμα +2
Λόγω κυρίως των λάνθασμένων απαντήσεων στο ιστόγραμμα, ο μέσος όρος σας στην Άσκηση 2 ήταν: 7.28
3. Τρίτη Άσκηση
α) Η βάση δόθηκε σε όσους εντόπισαν έστω μία εξπανσίνη και δημιούργησαν μια παρουσίαση με τα βασικά χαρακτηριστικά της.
β) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους σχολίασαν την οικογένεια και όχι μόνο ένα μέλος.
γ) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους εντόπισαν αλληλεπιδράσεις και τις ανέφεραν (είτε σαν δίκτυο, είτε σαν λίστα).
δ) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους ανέφεραν τις λειτουργικές υπομονάδες των εξπανσινών από την Prosite.
ε) Μία επιπλέον μονάδα δόθηκε σε όσους παρουσίασαν τις διάφορες πρωτεϊνες σε ξεχωριστά slides με τα επιμέρους χαρακτηριστικά της καθεμίας, αντί π.χ. για slides που είχαν όλες τις αλληλουχίες μαζί, μετά όλες τις δομές μαζί κλπ, τα οποία δεν είναι λειτουργικά.
στ) Μία μονάδα επιπλέον δόθηκε ανάλογα με την αισθητική της παρουσίασης (χρήση χρωμάτων, γραμματοσειρών κλπ)
Συνολικά:
Μια εξπανσίνη +5
Οικογένεια +1
Αλληλεπιδράσεις +1
Λειτουργικές υπομονάδες (domains) +1
Διακριτή παρουσίαση +1
Αισθητική παρουσίασης +1
Ο μέσος όρος σας στην Άσκηση 3 ήταν: 7.98
RSS Feed
